MMM脉动真空灭菌柜的灭菌原理是通过真空泵借助水的流动抽出灭菌柜室内冷空气，使其处于负压状态，然后输入饱和热蒸气，使其迅速穿透到物品内部，如此反复3次或4次。
在高温和高压力的作用下使微生物蛋白质变性凝固而灭活达到灭菌要求。灭菌后，抽真空使灭菌物品迅速干燥。工作流程采用电脑控制，具有方便、省时、省力、总灭菌时间短、灭菌可靠、物品干燥等特点，是医院医用物品消毒灭菌*的仪器之一。
MMM脉动真空灭菌柜工作时，微生物承受热力作用后，蛋白质分子的运动会加速，互相撞击，以此致使连接肽链的付键出现断裂，其分子由具备规律性的紧密构造，转变成无秩序的散漫构造，大量的疏水基会在分子表面暴露，并且相互融合为非常较大的聚合体而沉淀凝固，即借助不可逆地把结构蛋白和酶破坏掉，实现杀灭微生物的目的。
干燥阶段，先抽真空将内部蒸汽抽出，然后再补入已过滤的热压缩空气（灭菌柜有换热器和除菌过滤器，压缩空气进入内腔首先先经过除菌过滤器过滤，然后经过换热器加热进入设备内腔，如果不加热，冷压缩空气就会进入内腔使蒸汽凝结成水，不过滤就会引入细菌，灭菌失败），连续重复几次达到干燥效果。
在这里强调一下，干燥就是跟升温差不多相反的一个过程。基本上程序没问题的话，本来就是干燥的物品通过灭菌后都是干燥的，至于干燥次数一般根据灭菌物品来定，如果是器具的话次数会少一点，衣服的话次数多一点。
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